Exemplo de script em .bat:
net use X: \\NOME_DO_SERVIDOR\DIRETORIO
obs.: a letra da unidade pode ser trocada por qualquer outra que o sistema já não esteja usando.
Exempor de script em VBS:
Set objNet = CreateObject("WScript.Network")
objnet.MapNetworkDrive "I:","\\NOME_DO_SERVIDOR\DIRETORIO"
Para mapear mais diretórios, basta repetir a segunda linha.
obs.: a letra da unidade pode ser trocada por qualquer outra que o sistema já não esteja usando.